Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 绘制卟啉分子

好酷屋教程网小编为您收集和整理了Materials Studio官方教程（Help-Tutorials）- 绘制卟啉分子的相关教程：背景：卟啉是含有四个吡咯环的大环化合物，通过单碳桥连接。分子是扁平的，具有18个π电子的共轭系统。在吡咯环上具有各种侧链的卟啉衍生物是自然界中一些最重要的维持生命的化合物。一个例子是血红

背景：卟啉是含有四个吡咯环的大环化合物，通过单碳桥连接。 分子是扁平的，具有 18 个 π 电子的共轭系统。 在吡咯环上具有各种侧链的卟啉衍生物是自然界中一些最重要的维持生命的化合物。 一个例子是血红素，一种负责动脉血呈红色的铁卟啉复合物。 您将在本练习中构建的分子是卟啉，它是所有卟啉的核心：

简介：在本教程中，您将使用 Materials Visualizer 中的草图绘制工具来绘制 porphine。 这将要求您复制、粘贴、旋转和翻译单个片段，从而将您引入 Materials Visualizer 环境。

目的：介绍片段的操作和Display Style对话框的使用。

本教程重要节点：

绘制一个五元环-复制、粘贴、平移和旋转片段-连接片段-编辑键类型-添加氢原子并Clean结构-更改显示样式与导出图像

1.绘制一个五元环

使用Sketch Ring按钮

来绘制一个五元环。绘制完成后，按下Shift，同时选择单个C原子，并采用上一个案例中的方法将其替换为N原子。

注意：在进行绘制的时候按下Shift将变为选择模式，而不是进行绘制。要取消选择，请在按下Shift的同时单击空白区域取消选择。    

2. 复制、粘贴、平移和旋转片段

在这一部分，我们将进行三个片段的拷贝，并对其进行平移、旋转操作已得到其相应的位置。第一步需要选择一个片断。

用3D viewer中的3D Viewer Selection Mode选择好五元环以后，使用拷贝、粘贴命令，将五元环复制到文档中。

注意：同时按下键盘上的Shift和Alt键，并使用鼠标右键将对所选中的片段进行平移操作；按下键盘上的Shift健，并使用鼠标右键将对所选中的片段进行旋转操作(当鼠标沿着屏幕的边缘移动时，将绕Z轴进行旋转，在屏幕内沿着X轴移动时，将绕Y轴旋转，在屏幕内沿着Y轴移动时，将绕X轴旋转)。

3.连接片段

选择Sketch Atom工具，用碳原子将单个吡咯连接为完整的卟啉分子。

4.编辑键类型

现在我们已经绘制了所有的非氢原子，这时需要编辑相应的键级以获得最终的分子结构。现在有两种方法可以完成此操作，一是单独使用Sketch Atom工具，单击某个单键改变该键的键级，此方法在只需要定义少量键的时候非常有用，但是对于要改变很多键的键级则需要使用第二种方法。

在按下Shift的同时使用选择工具选择多个单键，并在Sketch/Modify Bond Type工具

上选择Double Bond。

5. 添加氢原子并Clean结构

对整个结构加入相应的氢原子并整理结构。如果在上一步中定义了正确数量的双键，那么在这一步里，每一个桥碳原子上会有一个氢原子，同时会有两个氮原子与两个氢原子相连，每个吡咯环上会有两个氢原子相连接。如果氢原子数目不对，请返回第4步并重新定义双键数目。 

6.更改显示样式与导出图像

从Display Style中可以改变分子的显示模型，并可以改变相应的球、棍的半径大小。

从Display Option中可以改变整个文档显示的风格，包括背景色等。

在完成显示风格修改之后，可以将屏幕上所看到的分子输出为.bmp文件，这样就可以将图片输入到其它程序中，或者使用与交流。

从File菜单中选择Export命令，在文件类型部分选择.bmp，此时相应的Option选项被激活，在这里我们可以定义bmp文件的高度和宽度。设置完成后选择相应的文件夹，并单击Save按钮。

注意：无论导入或导出的文件均只能保存在纯英文路径下。

本入门教程到此结束。

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